Theo khoản 5 Điều 7 Nghị định số 20/2026/NĐ-CP quy định: "Trường hợp trong kỳ tính thuế đầu tiên mà doanh nghiệp khởi nghiệp, sáng tạo, công ty quản lý quỹ đầu tư khởi nghiệp sáng tạo, tổ chức trung gian hỗ trợ đổi mới sáng tạo, doanh nghiệp nhỏ và vừa quy định tại khoản 1 và khoản 3 điều này có thời gian hoạt động sản xuất, kinh doanh được miễn thuế, giảm thuế dưới 12 tháng thì được lựa chọn hưởng miễn thuế, giảm thuế theo quy định tại Nghị định này ngay từ kỳ tính thuế đầu tiên đó hoặc đăng ký với cơ quan thuế thời gian bắt đầu được miễn thuế, giảm thuế từ kỳ tính thuế tiếp theo." 

Căn cứ quy định trên, Công ty đã thực hiện nộp thuế TNDN cho kỳ tính thuế năm 2025, đồng thời làm công văn gửi Thuế cơ sở 6 TP.HCM đề nghị dời thời gian bắt đầu được hưởng miễn thuế TNDN sang kỳ tính thuế tiếp theo (2026, 2027, 2028). Tuy nhiên, khi làm việc với Thuế cơ sở 6 TP.HCM vào tháng 03/2026, Công ty nhận được câu trả lời là doanh nghiệp tự xác định thời gian hưởng miễn thuế theo nghị định và không cần nộp công văn cho cơ quan thuế. Điều này dẫn đến rủi ro pháp lý cho Công ty khi không có văn bản/xác nhận chính thức từ cơ quan thuế về việc chấp thuận cho hưởng miễn thuế TNDN từ kỳ tính thuế 2026.

Tôi xin hỏi, các thủ tục, quy trình cần thực hiện để doanh nghiệp làm đúng theo quy định tại Nghị định số 20/2026/NĐ-CP và bảo đảm căn cứ pháp lý sau này.